Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf1Q9Z1B8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf1Q9Z1B8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms