Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sh3bp5Q9Z131 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms