Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NgfrQ9Z0W1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms