Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn13Q9Z0S4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms