Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx9Q9WUH2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx9Q9WUH2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms