Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nrf1Q9WU00 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms