Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp18Q9WTV6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Usp18Q9WTV6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp18Q9WTV6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp18Q9WTV6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Usp18Q9WTV6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp18Q9WTV6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp18Q9WTV6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp18Q9WTV6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp18Q9WTV6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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