Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam50bQ9WTJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam50bQ9WTJ8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms