Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trpc2Q9R244 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms