Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rfwd2Q9R1A8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rfwd2Q9R1A8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms