Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabrg1Q9R0Y8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabrg1Q9R0Y8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms