Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Zeb2Q9R0G7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zeb2Q9R0G7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms