Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nek3Q9R0A5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Nek3Q9R0A5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nek3Q9R0A5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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