Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gpc6Q9R087 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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