Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
AmfrQ9R049 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AmfrQ9R049 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms