Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtsjQ9R014 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms