Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col4a3Q9QZS0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col4a3Q9QZS0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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