Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Exo1Q9QZ11 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Exo1Q9QZ11 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Exo1Q9QZ11 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exo1Q9QZ11 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Exo1Q9QZ11 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Exo1Q9QZ11 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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