Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VapbQ9QY76 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms