Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tspan3Q9QY33 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tspan3Q9QY33 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms