Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX66

Dpf1, Zinc finger protein neuro-d4, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf1Q9QX66 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf1Q9QX66 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Dpf1Q9QX66 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dpf1Q9QX66 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms