Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc5Q9QX29 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc5Q9QX29 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms