Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mid2Q9QUS6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms