Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1eQ9JMK2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms