Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Txnrd1Q9JMH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Txnrd1Q9JMH6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms