Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gkap1Q9JMB0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms