Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp1Q9JLK7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp1Q9JLK7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp1Q9JLK7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms