Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cabp2Q9JLK4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp2Q9JLK4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms