Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CubnQ9JLB4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms