Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nova1Q9JKN6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nova1Q9JKN6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms