Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Scamp5Q9JKD3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms