Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ap3m1Q9JKC8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ap3m1Q9JKC8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms