Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ybx3Q9JKB3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ybx3Q9JKB3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms