Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pard6bQ9JK83 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pard6bQ9JK83 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms