Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gfra4Q9JJT2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra4Q9JJT2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms