Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Riox1Q9JJF3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Riox1Q9JJF3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms