Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Lmbr1Q9JIT0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Lmbr1Q9JIT0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms