Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slc12a4Q9JIS8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc12a4Q9JIS8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms