Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Kcnmb4Q9JIN6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms