Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms