Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lgi1Q9JIA1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms