Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHX2

Sp5, Transcription factor Sp5, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp5Q9JHX2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sp5Q9JHX2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sp5Q9JHX2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms