Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DysfQ9ESD7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DysfQ9ESD7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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