Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Aff4Q9ESC8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms