Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trappc4Q9ES56 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc4Q9ES56 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms