Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trhr2Q9ERT2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trhr2Q9ERT2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms