Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Barx1Q9ER42 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Barx1Q9ER42 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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