Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rhox9Q9EQM5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rhox9Q9EQM5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms