Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r29Q9EQ41 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r29Q9EQ41 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms