Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms